市场监管局在诊所查出9盒过期药品（过期45天）

诊所销售过期药品将受处罚。依据《药品管理法》，销售劣药需没收药品及违法所得，并处罚款；情节严重可停产停业、吊销许可证等。过期药品危害患者健康，必须及时处理。
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诊所应接受处罚。具体操作：1.立即停止销售过期药品；2.配合市场监管局调查，提供所需资料；3.按要求整改，如销毁过期药品、改进管理制度；4.如有异议，可申请行政复议或听证；5.缴纳罚款，执行处罚决定，避免进一步法律后果。
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常见处理方式为接受处罚并整改。根据违规情节轻重，选择配合调查、积极整改或申请听证等。轻微违规可主动整改避免更重处罚，严重违规需重视并配合处理。